Abstrait

Caractérisation du génome chloroplastique complet de Rhus Chinensis (Anacardiaceae), une plante médicinale et économique importante de Chine

Zhumei Ren, Ting Lv, Xu Su et Jun Wen

Rhus chinensis est un arbre à feuilles caduques commun dans la zone tempérée chaude de l'Asie de l'Est, sur lequel les pucerons chinois du sumac vivent pour former des noix de galle aux tannins riches. Ici, nous avons assemblé le génome chloroplastique complet de R. chinensis avec la méthode d'écrémage du génome par tir sur une plate-forme Illumina HiSeq4000. Le génome chloroplastique complet de R. chinensis mesurait 149 083 pb et avait une structure quadripartite standard avec les grandes régions à copie unique (LSC, 97 271 pb) et les petites régions à copie unique (SSC, 18 524 pb) séparées par une paire de répétitions inversées (IR, 16 644 pb chacune). Nous avons annoté avec succès 126 gènes, dont 82 gènes codant pour des protéines, 36 gènes d'ARNt et huit gènes d'ARNr. Parmi ces gènes, 29 gènes étaient situés dans des régions IR. La teneur globale en GC du génome chloroplastique complet atteint largement 45,5 %.