Abstrait

Méthylation dynamique de l'ADN des rétrotransposons dans la rue sous stress hydrique

Bruna De Felice, Olga De Castro et Francesco Manfellotto

Ruta graveolens (rue) est une plante originaire de la région méditerranéenne et présente dans la médecine traditionnelle de cette région depuis l'Antiquité. Il existe peu d'informations sur le génome de Ruta et les séquences répétitives et les éléments génétiques mobiles actifs n'ont pas encore été identifiés. Étant donné que le génome de la rue est encore largement inexploré et que la capacité proliférative et la grande taille des transposons en font des contributeurs clés à la taille et à l'évolution du génome, nous avons cherché à isoler et à caractériser les séquences de transposons en vue de mieux comprendre le génome de la rue. Nous avons isolé de nouveaux types de transcriptase inverse LTR de type Ty1-copia de Ruta graveolens, ce qui a conduit à l'étude de l'organisation génomique et des relations phylogénétiques. Étant donné que l'activation des éléments transposables en réponse aux changements environnementaux représente une forme de réponse adaptative au stress biotique, nous avons étudié si le stress dû à la sécheresse pouvait influencer la méthylation des transposons et si l'étendue de la méthylation était liée au niveau d'expression. Les résultats peuvent avoir des implications pour la compréhension du génome de la rue et leur impact potentiel sur l'évolution de Ruta.