Abstrait

Identification et quantification de Tilletia caries et T. controversa dans des échantillons de semences et discrimination des deux espèces

Zgraja G, Kramer S, Jonitz A et Wagner W

La carie puante ou commune, causée par Tilletia caries, et la carie naine du blé, causée par T. controversa Kühn, sont des maladies majeures transmises par les semences chez les céréales et les espèces de prairies (Graminaceae). Les niveaux de contamination sont systématiquement contrôlés par des organismes de certification ou des laboratoires de contrôle officiels. Nous rapportons plusieurs tests PCR qui ont été développés pour l'identification et la quantification de Tilletia spp. dans des échantillons de blé et d'épeautre contaminés. Un segment de 140 pb de la région ITS est amplifié par PCR qualitative à des fins de dépistage ou par PCR en temps réel pour la quantification. La méthode a été validée avec succès en interne et dans un test de compétence en comparaison avec d'autres méthodes établies. De plus, une PCR-RFLP a été développée pour la discrimination des espèces. En utilisant HinfI comme endonucléase de restriction, la séquence PRB2 de T. caries est digérée en trois fragments alors qu'il n'y en a que deux chez T. controversa. Dans les analyses de routine et la surveillance des lots de semences ou des matières premières pour aliments des animaux, cette approche PCR constitue une alternative appropriée aux méthodes microscopiques traditionnelles, longues et laborieuses.