Ce sujet traite des techniques, des applications et des résultats en relation avec l'évolution, pour être plus spécifique, la phylogénie traite de la divergence des espèces en référence à leurs propriétés moléculaires, géographiques et autres. En général, la divergence des différentes espèces est calculée en fonction des caractéristiques synonymes et non synonymes des séquences, une estimation du taux d'évolution est effectuée et une compréhension scientifique liée à la pression de sélection sur des gènes, protéines ou organismes particuliers selon la théorie neutre est prise en compte sous ce sujet.
Revues connexes : Phylogénétique moléculaire et évolution.