Abstrait

Un modèle pronostique pour le carcinome hépatocellulaire basé sur un ARN long non codant connu lié à la ferroptose

Congyue Zhang1,2, Chaoqun Zhang1,2, Huifang Zhou2, Zhankai Hu1, Dianxing Sun2*

Contexte : Le carcinome hépatocellulaire (CHC) est une affection maligne répandue dans le monde entier, et la ferroptose est un processus de mort cellulaire dépendant du fer. De plus, l'expression aberrante de longs ARN non codants (lncRNA) qui contribuent au développement et à la progression du CHC a suscité un intérêt croissant.

Matériel et méthodes : Nous avons recueilli les profils d'expression des lncRNA associés à la ferroptose et les informations clinicopathologiques à partir des bases de données The Cancer Genome Atlas (TCGA) et FerrDb. La relation entre les lncRNA liés à la ferroptose (FRlncRNAs) et la survie des patients atteints de CHC est déterminée par une analyse de co-expression de la survie globale (OS). À l'aide de l'analyse de régression de Cox et de l'algorithme LASSO, un modèle pronostique de lncRNA de 22 lncRNA exprimés de manière différentielle a été développé.

Résultats : Un profil d'ARNnc à haut risque était associé à un mauvais pronostic du CHC, comme le déterminait une analyse de Kaplan-Meier. Pour prédire le pronostic du CHC, notre modèle d'évaluation des risques a surpassé les données cliniques conventionnelles. La GSEA a mis en évidence des voies immunitaires et tumorales chez les individus à haut risque et à faible risque. De plus, la TCGA a révélé que les fonctions des lymphocytes T, telles que les lymphocytes B, les macrophages cytolytiques, le CMH de classe I, les mastocytes, les neutrophiles, les cellules NK, les lymphocytes T auxiliaires, l'IFN de type I et l'IFN de type II, différaient significativement entre les groupes à haut risque et les groupes à faible risque. Les points de contrôle immunitaires étaient également exprimés différemment entre les groupes à risque, notamment TNFSF18, IDO2, CD276, NRP1 et TNFSF4.

Conclusion : Sur la base des lncRNA associés à la ferroptose, nos résultats fournissent un modèle robuste de prédiction du pronostic et de la réponse immunitaire pour les patients atteints de CHC.