Abstrait

Biomodélisation computationnelle et analyse de la structure 3D du proto-oncogène humain c-Rel : une protéine activatrice de la tumorigenèse

Atala Bihari Jena et Shasank Sekhar Swain

Avec l'avènement de la recherche biomédicale dans le domaine des sciences humaines, plusieurs protéines présentes dans le corps humain constituent un danger pour la santé. La protéine proto-oncogène c-Rel se trouve principalement chez l'homme et est codée par le gène REL et appartient à la famille des facteurs de transcription Rel/NF-kB, qui régule une grande variété de fonctions cellulaires. Le proto-oncogène est impliqué et joue un rôle important dans la différenciation et la lymphopoïèse. Le proto-oncogène peut être nocif et provoquer le cancer lorsqu'il est muté. Pour comprendre le mécanisme de fonctionnement de la protéine proto-oncogène c-Rel HUMAINE, il est impératif de comprendre le modèle structurel de cette protéine particulière, mais la structure tridimensionnelle (3D) n'a pas encore été rapportée dans la Protein Data Bank (PDB). Dans la présente étude, une analyse structurelle complète et une modélisation 3D du proto-oncogène humain c-Rel d'Homosapiens. Sur la base du rapport PDB Blast, la structure tridimensionnelle de la protéine proto-oncogène c-Rel a été prédite à l'aide du MODÈLE SWISS. Le modèle prédit a été évalué plus avant par SAVES (PROCHEK, VERIFY 3D, ERRAT) et Ramachandran Server, qui ont montré des scores acceptables et la fiabilité du modèle final raffiné. Le résultat global fournit la preuve de la bonne qualité du modèle et fournit une base adéquate pour l'analyse fonctionnelle des structures cristallines dérivées expérimentalement et aide également à la recherche sur le cancer en fournissant un nouveau point de départ pour la conception de médicaments basés sur la structure de la protéine proto-oncogène c-Rel.