Abstrait

Criblage à l'échelle du génome des modules liés à la paroi cellulaire de Mycobacterium tuberculosis basé sur une analyse de co-expression à grande échelle

Huaidong Wang, Bingqiang Liu, Zhuoyuan Xin, Zipeng Duan, Xiaoyu Sun, Yan Lin, Zhifeng Yang, Guoqing Wang*, Fan Li*

La paroi cellulaire de Mycobacterium tuberculosis joue un rôle important dans la pathogenèse. Il est impossible d'analyser les gènes associés à la paroi cellulaire un par un en raison de l'absence d'annotation fonctionnelle. Ici, nous avons effectué une analyse de regroupement des données d'expression de puces à ADN et acquis 33 modules de co-expression par la construction de trois réseaux de nœuds co-régulés. Un total de 555 gènes liés à la paroi cellulaire ont été prédits dans les modules à l'aide d'un modèle de régression logistique multifactorielle et d'une analyse de prédiction de motifs. L'analyse des modules a identifié 15 gènes sans annotation qui étaient également associés à la paroi cellulaire. Vingt-cinq modules contenaient des motifs significatifs et les gènes de 10 de ces 25 modules partageaient un motif commun. L'approche méthodologique utilisée ici peut être appliquée à l'identification et à la description d'autres gènes associés à la fonction dans le génome de M. tuberculosis. Les résultats de cette étude pourraient améliorer la compréhension de la paroi cellulaire de M. tuberculosis et la recherche de nouvelles cibles pour les médicaments antituberculeux.