Abstrait

Sélection et test à l'échelle du génome de gènes de référence supérieurs pour la normalisation quantitative de l'expression génétique dans le tabac (Nicotiana tabacum)

Yushuang Guo, Ruiyuan Li, Zeshan Asgher, Imran Haider Shamsi, Shizhou Yu, Jiehong Zhao et Xueliang Ren

La qRT-PCR est un outil très précis pour la mesure de l'expression des gènes dans tous les organismes. Des résultats précis et reproductibles de la qRT-PCR dépendent de la normalisation des données d'expression à l'aide de gènes de référence fiables. Pour diversifier le pool de gènes de référence fiables dans le tabac, la stabilité de l'expression de 44 873 gènes du tabac (EST) a été mesurée à l'aide d'un microarray conçu sur mesure dans un ensemble diversifié de 21 échantillons, représentant divers types de tissus et stades de développement. Au total, 14 gènes ont été sélectionnés comme gènes de référence candidats car ils semblaient être les plus stables. Ces gènes ont été comparés à deux gènes domestiques largement utilisés (L25 et EF-1a) pour une validation supplémentaire par qRT-PCR. Les résultats ont montré que le gène 3 (NADH déshydrogénase) et le gène 4 (chaperonine CPN60-2) présentaient la plus grande stabilité d'expression et qu'ils étaient encore plus stables que L25 et EF-1a. Pris ensemble, nos résultats fournissent un pool plus large de gènes de référence stables pour l’analyse de l’expression génétique du tabac.