Abstrait

Diversité génomique des espèces d'Arcobacter isolées des eaux de surface

Rodrigo Alonso, Irati Martínez-Malaxetxebarria, Cecilia Girbau, Sandra Carmona, Héctor Velasco, Aurora Fernández-Astorga

Au total, 45 isolats non clonaux d'Arcobacter récupérés dans des échantillons d'eaux usées et d'eau de rivière collectés autour de Vitoria-Gasteiz, au nord de l'Espagne, ont été étudiés. Nos résultats ont confirmé qu'A. butzleri était l'espèce la plus prédominante, bien qu'A . cryaerophilus et A. lanthieri aient également été identifiés. Huit isolats ont montré des résultats discordants avec les m-PCR d'identification. Sur la base de la séquence du gène rpoB, deux de ces huit isolats se sont avérés être A. lanthieri . Cependant, les six autres semblaient être de nouvelles espèces possibles nécessitant une analyse supplémentaire. L'occurrence de gènes associés à la virulence était significativement (P<0,05) plus élevée chez A. butzleri . Sept des dix gènes associés à la virulence étudiés ( ciaB, mviN, tlyA, cadF, pldA, cj1349 et hecA ) étaient présents dans un grand nombre d'isolats. Français Parmi eux, le gène hecA était significativement (P<0,05) lié aux isolats des eaux usées. Le MLST a montré un taux élevé de diversité génétique pour les isolats d'A. butzleri . Cependant, il n'y avait aucun signe de relation entre les ST et la présence de gènes liés à la virulence. En conclusion, la population d'Arcobacter dans les eaux de surface peut être plus variée en espèces que détectée car la plupart des milieux d'enrichissement et des techniques moléculaires sont conçus sur la base d' A. butzleri et cela peut biaiser les informations en faveur de cette espèce. De plus, nous avons trouvé une relation possible entre le contenu des gènes associés à la virulence et l'origine des isolats.