Abstrait

Impact de l'épilepsie et de l'infection à Giardia Intestinalis sur le microbiome intestinal des espèces canines

Parc Chan-Yeong, Sung-Seok Lee, Hyun-Hee Seo, Dong-Uk Ha, Ha-Da Jang, Hyun-Ah Yu, San Kim*

Le rôle du microbiome intestinal dans la santé de l'hôte suscite un intérêt croissant, car il joue divers rôles dans le maintien de l'homéostasie. Il a été démontré que la composition du microbiome est associée à des facteurs tels que l'âge, la race, le sexe, la répartition géographique et les caractéristiques génétiques. Cependant, l'étendue complète de l'interaction entre le microbiome intestinal et l'hôte reste inconnue. Par rapport aux humains, peu d'études ont été menées sur le microbiome intestinal des animaux de compagnie. Dans cette étude, nous avons analysé le microbiome intestinal canin à l'aide de la base de données SRA du National Center for Biotechnology Information (NCBI). Un total de 982 données SRA, comprenant 1,22 TB, provenant de 8 pays ont été incluses. L'analyse de redondance basée sur la distance (dbRDA) a révélé une forte corrélation entre la présence de Peptoclostridium et l'épilepsie, et entre la présence de Fusobacterium et l'infection à Giardia intestinalis. Grâce à une analyse de réseau utilisant le coefficient de corrélation basé sur le rang de Spearman (ρ), nous avons identifié des biomarqueurs potentiels en examinant les interactions au sein des listes de genres. Les résultats indiquent que la composition du microbiome intestinal canin varie en fonction des microbes spécifiques à la maladie, ce qui suggère que ces listes d’espèces pourraient servir de biomarqueurs candidats pour l’épilepsie et l’infection à Giardia intestinalis.