Abstrait

Criblage in silico de la protéine Rv3228 pour avoir une vision de la survie et de la pathogenèse de Mycobacterium tuberculosis H37Rv

Hanisha Sharma, Swati Meena, Laxman S Meena

La tuberculose est devenue un problème de santé majeur dans le monde, près d'un tiers de la population mondiale étant aujourd'hui infectée par le pathogène responsable Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis). M. tuberculosis est une bactérie Gram positive qui rend très difficile son élimination totale. Rv3228 est un gène hypothétique conservé de M. tuberculosis. Rv3228 est une protéine de liaison GTP/ATP attendue. Il présente également une activité de liaison aux ions métalliques ou GTPase. Les GTP/ATP sont des molécules riches en énergie qui facilitent la liaison du facteur protéique respectif soit aux ribosomes, soit à l'ARNt. Ce manuscrit a considéré certains des aspects intéressants de la protéine Rv3228 dont la fonction est inconnue. Les principales visions de cette étude comprennent la récupération de la base de données de séquences protéiques, l'alignement de séquences multiples, l'étude des interactions de chaînes, la localisation sous-cellulaire, la prédiction de la liaison des ligands, la prédiction des épitopes des cellules B et T, la prédiction de la fonction basée sur la structure par COFACTOR et VICMpred. VICMpred prédit que ce gène est un facteur de virulence. Modélisation Ab-Inito par RAPTOR X et validation par RAMPAGE, ERRAT et VERIFY3D, analyse des mutations par MAESTRO WEB SERVER. Cette étude sera utile au développement de nouveaux médicaments et au traitement de la tuberculose.