Abstrait

Gène de type TaWUS Homeobox spécifique à la plante associé au poids de mille grains et au nombre de grains dans le blé tendre

Xuemei Si, Shoaib Ur Rehman, Yuquan Wang, Jian Hou, Chenyang Hao, Tian Li, Xueyong Zhang, Hongxia Liu*

Le gène WOX ( WUSCHEL-related homeobox ) est un gène homéobox spécifique aux plantes contenant un facteur de transcription (TF). WUSCHEL joue un rôle essentiel dans les événements de développement des plantes et le rendement des cultures. Dans la présente étude, trois copies de TaWUS-like ont été isolées des chromosomes 5A , 5B et 5D du blé commun. Les TaWUS-like ont été étudiés pour le polymorphisme de séquence afin de réaliser l'association de traits marqueurs (MTA). Vingt variations de polymorphismes de nucléotides simples (SNP) et six insertions et délétions (InDels) ont été identifiées dans le promoteur (2,0 kb-3,0 kb) et les régions codantes parmi les trois copies d' homéologues de type TaWUS . Pour le génotypage à haut débit, des marqueurs PCR spécifiques aux allèles compétitifs (KASP) ont été développés. Français Les haplotypes favorisés étaient significativement associés au poids de mille grains (TGW) ( 5B-HapI et 5D-HapI ) et au nombre de grains (GN) ( 5A-HapI et 5B-HapI ) dans la population de blé collectée en Chine. Plus de polymorphismes de séquence présentés dans le génome TaWUS-like-5B que ceux des génomes TaWUS-like-5A et TaWUS-like-5D . L'absence de polymorphismes de séquence dans les accessions diploïdes étudiées pour les TaWUS-like et la présence dans les accessions de blé tétra et hexaploïdes étudiées ainsi que le contenu en informations polymorphiques et les valeurs de diversité génétique suggèrent que les événements de polyploïdisation ont entraîné une augmentation de la diversité génétique pour TaWUS-like-5A tandis qu'une diminution de la diversité pour TaWUS-like-5B et TaWUS-like-5D . La distribution géographique et la fréquence allélique ont indiqué que les haplotypes favorisés ont subi une sélection positive mais moins intensive, ce qui indique une sous-utilisation des TaWUS-like dans la sélection du blé. Les marqueurs KASP développés peuvent contribuer à l’amélioration du rendement en grains par sélection assistée par marqueurs dans les programmes de sélection du blé.