Abstrait

Sélection de gènes de référence pour une comparaison de la biosynthèse des flavonoïdes de L. confusa et L. japonica

Qiao-cheng MO, Mu-xiu TAN, Dan-na HUANG, Feng-hua SHI*

La stabilité de 8 gènes de référence candidats dans 4 tissus de L. confusa et L. japonica a été évaluée en utilisant quatre algorithmes pour évaluer la validité des gènes de référence pour leur utilisation dans la normalisation précise des données qRTPCR. Les 8 gènes de référence candidats sont β-TUB, eIF-4a, ACT11, eEF-1α, GAPDH, UBQ10, 18S et 25S, et les 4 tissus étaient des feuilles, des bourgeons verts, des bourgeons blancs et des fleurs blanches. Les résultats ont montré que les gènes les plus stables sélectionnés par les quatre algorithmes de ces 8 gènes sont légèrement différents pour ces tissus, mais les gènes les moins stables étaient les mêmes dans chaque cas. ACT11, eIF-4a et β-TUB sont les trois gènes les plus stables sélectionnés par geNorm, β-TUB est le plus stable selon Delta CT et Normfinder, et GAPDH par Bestkeeper. Les gènes 18S et 25S étaient les deux gènes les moins stables selon les quatre algorithmes. Pour vérifier la validité de ces gènes sélectionnés par les quatre méthodes, le niveau d'expression comparatif du gène FSⅡ dans ces 8 tissus a été normalisé avec eux. Des profils d'expression similaires de FSⅡ ont été observés avec les gènes les plus stables sélectionnés par les quatre méthodes et le plus élevé a été trouvé dans les feuilles et le plus bas dans les fleurs de L. confusa. Mais ils sont apparemment différents des profils soumis à la normalisation par les deux gènes les moins stables : 18S et 25S. Cela a démontré que les gènes de référence appropriatifs sont indispensables pour les analyses de profils génétiques, et ces gènes recommandés par les quatre algorithmes sont tous fiables. Il s'agit du premier rapport sur la sélection de gènes de référence candidats dans les espèces de Lonicera et cela fournira une comparaison plus précise de l'expression des gènes dans la voie de biosynthèse des flavonoïdes entre L. confuse et L. japonica.

Avertissement: Ce résumé a été traduit à l'aide d'outils d'intelligence artificielle et n'a pas encore été examiné ni vérifié

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